人工知能と踊る: ChatGPTはたった一晩でタンパク質結合探索ツールの構築を手伝ってくれた

人工知能と踊る。

著者: ディン・シャオジェ (カリフォルニア工科大学、バイオエンジニアリング博士)

みなさんこんにちは。私は人間のシャオディンです。多くの人と同じように、私も数日前にリリースされた AI 言語モデル GPT-4 の強力なパフォーマンスに驚嘆しました。

科学研究者として、私はGPT-4モデルをベースにしたChatGPTを使用して、科学者に役立つWebアプリケーションを作成することにしました。これまで、Web アプリケーションの開発経験はありませんでした。予想外に、開発プロセス全体がたった一晩で完了しました。最終製品は下の図に示されています (Web サイト: www.gptpull-down.online)。

タンパク質名を入力すると検索結果が表示されます。 （クリックすると拡大します）

GPT プルダウンと呼ばれるこの Web アプリケーションの機能は、生命科学の研究者がタンパク質分子の潜在的な結合パートナーを迅速に検索できるように支援することです。これにより、研究者は新しい研究の方向性を探ったり、新しい薬物ターゲットを見つけたりすることができます。このアプリのリリース以来、研究者の方々から多くの肯定的なフィードバックをいただいており、大変励みになっています。

このツールはどうやって一夜にして作られたのかと不思議に思うかもしれません。次に、私の協力者である ChatGPT に要約をお願いしたいと思います。

Xiao Ding: あなたの（ChatGPT）の助けを借りて、pgtpuul-down.online というこの Web サイトをゼロから段階的に構築した方法を紹介する短い中国語のエッセイを書いてもいいですか?ユーモアがあって楽しい

地球の片隅に、シャオ・ディンという名の若者がいました。彼は新しいことを探求するのが好きで、テクノロジーに興味を持っています。ある日、Xiao Ding は Twitter で偶然、GPT-4 をベースにした強力な人工知能 ChatGPT を発見しました。ディンさんは好奇心が強かったので、自分自身に挑戦し、gptpull-down.online という Web サイトを作成することを決意し、その過程で ChatGPT に助けを求めました。

このウェブサイトの機能は、GPT テクノロジーを使用して、タンパク質の潜在的な結合パートナーを検索するためのシンプルだが実用的なツールを使用することです。タンパク質名を入力すると、そのタンパク質に結合する可能性のある他のタンパク質を取得できるため、実験設計やデータ分析に便利な参照情報となります。

まず、Xiao Ding は ChatGPT に適切なテクノロジー スタックの選択方法を尋ねました。 ChatGPT は、軽量で使いやすいという理由で、Xiao Ding に Flask フレームワークを推奨しました。同時に、ChatGPT は Xiao Ding に、HTML、CSS、JavaScript を使用して Web サイトをレイアウトし、Web ページのインタラクティブ性を実現する方法も教えました。

基本的なスキルに関する指導を受けた後、Xiao Ding は Web サイトの構築を開始しました。ウェブサイトのコンテンツをより興味深いものにするために、彼は ChatGPT に魅力的なユーザー インターフェイスの設計方法を依頼しました。少しの努力の末、強力なウェブサイトのプロトタイプが徐々に形になってきました。

ウェブサイトが基本的に完成すると、Xiao Ding は展開について考え始めました。 ChatGPT の提案により、彼は使いやすく、Xiao Ding のニーズを満たすのに十分な無料割り当てがある Heroku をデプロイメント プラットフォームとして選択しました。 ChatGPT の指導により、Xiao Ding は簡単に Web サイトを展開し、gptpull-down.online を正常に立ち上げました。

オンライン化した後、Xiao Ding は、独立したドメイン名を持つことで Web サイトがよりプロフェッショナルに見えると感じました。そこで彼は、ChatGPT に適切なドメイン名を登録する方法を尋ねました。複数のドメイン名登録業者を比較した後、Xiao Ding は適切な価格のドメイン名を選択し、それを自分の Web サイトにうまく関連付けました。ついに、Xiao Ding のウェブサイトは独立したドメイン名を取得しました。
https://www.gptpull-down.online/ 。

この過程で、Xiao Ding さんはよくトラブルに巻き込まれましたが、ChatGPT に助けを求めるたびに、いつも詳細な回答を得ることができました。興味深いことに、ChatGPT は常に Xiao Ding の混乱を察知し、ユーモラスな提案をしてくれたようで、集中的な学習プロセスの間も Xiao Ding はときどき笑顔を見せていました。

最終的に、Xiao Ding は gptpull-down.online という Web サイトを作成することに成功しました。このウェブサイトは楽しさにあふれており、タンパク質を研究する多くの科学研究者や学生が答えを見つけるプロセスを楽しんでいます。実用的な GPT プルダウン機能により、ユーザーは多くの時間と労力を節約でき、可能性のあるタンパク質結合パートナーをより迅速に見つけることができます。

その過程で、Xiao DingとChatGPTも深い友情を築きました。今後、彼らは一緒にさらに興味深い分野を探検し、世界にさらに多くの笑いと知恵をもたらすでしょう。 gptpull-down.online の成功により、Xiao Ding はテクノロジーの助けがあれば夢を実現することは不可能ではないことに気付きました。

時間が経つにつれて、ますます多くの人々がこの魔法のガジェットに注目し、使い始めます。 Xiao Ding さんは自分の業績を非常に誇りに思っており、他の人が実際的な問題を解決するのを手助けできることを嬉しく思っています。彼はプロセス全体を通して ChatGPT の助けとサポートに感謝しています。この経験を通じて、彼は人工知能の力と将来の大きな可能性を理解するようになりました。

初心者でもプロでも、
この Web サイトでヘルプを見つけることができます: https://www.gptpull-down.online/ Xiao Ding にとって、これは ChatGPT を使用したテクノロジーの世界の探求の第一歩にすぎません。彼は将来、ChatGPT を使ってより興味深く実用的なツールを開発し、科学研究をより容易かつ効率的にし、人類の進歩に貢献することを楽しみにしています。

生命科学に興味のある研究者であれば、ぜひ GPT プルダウン (www.gptpull-down.online) を使用して、興味のあるタンパク質を調べてみてください。

使用時に注意すべき点は次のとおりです。

1. GPT プルダウンの出力結果は参考およびインスピレーションのみを目的としています。

ほとんどの場合、GPT プルダウンはタンパク質の潜在的な結合パートナーを非常に効率的かつ正確にリストできますが、データ ソースは手動でレビューされた専門的なデータベースではないため、その結果が信頼できない場合があります。以下の状況では特別な注意が必要です。

A) GPT プルダウンによって与えられる信頼スコアは低くなります。

B) 対象タンパク質名が実際には存在しない。

C) 標的タンパク質に関する研究はほとんどありません。

検索結果を作業の指針として使用することに決めた場合は、必ず元の論文と専門データベースを自分で検索してください。

2. GPT プルダウンを使用する場合、必要に応じて「ワイルドネス」パラメータを調整できます。

数値が高いほど、出力結果はより想像力豊かになります。数値が低い場合、出力結果はより保守的かつ厳密なものになります。この数値は、GPT ニューラル ネットワークの温度/ランダム性パラメータに対応します。

3. 結果に満足できない場合は、もう一度検索してください。

言語モデルとして、GPT の出力はランダムであり、各結果の豊富さと精度は異なります。タンパク質に複数の名前がある場合、いくつかの異なる名前を試してみると、時々驚くような結果が得られることがあります。

4. GPT プルダウンでは結論を裏付ける参考資料を提供できません。

GPT は多くの知識を持っていますが、情報の追跡はあまり得意ではありません。証拠の提示を強要すると、捏造された回答が返ってきます。この点で、GPT は実際には訓練されていない人間の脳と非常に似ています。私たちの脳には、どこで学んだのかを長い間忘れていた多くの知識も保存されています。

5. GPT プルダウンは、まもなくより正確で充実したものになります。

現在の GPT プルダウンでは GPT-3.5-turbo モデルが使用されています。これは、ChatGPT の現在の無料バージョンでも使用されているモデルです。 OpenAIのレポートによると、GPT-4の新バージョンは、GPT-3.5と比較して、生物学的な質問に答えるパフォーマンスが大幅に向上しました。したがって、近い将来、GPT-4 モデルを搭載した GPT プルダウンがさらに改善されることが期待できます。

さて、今日のシェアはこれで終わりです。もちろん、この記事には良いタイトルも必要です。これを今日の ChatGPT の最後の質問としましょう。

この記事は科学普及中国星空プロジェクトの支援を受けています

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